Grupy badawcze Instytutu Biologii US
Grupy badawcze Instytutu Biologii US
Skład Katedry:
dr hab. Łukasz Jankowiak, prof. US – kierownik katedry
dr hab. Agnieszka Grinn-Gofroń, prof. US
dr hab. Ewa Rębacz-Maron, prof. US
dr Michał Polakowski
dr Zbigniew Kwieciński
mgr Beata Kiriaka
Najważniejsze projekty bieżące:
dr hab. Łukasz Jankowiak, prof. US
dr Michał Polakowski; dr hab. Łukasz Jankowiak, prof. US
dr Michał Polakowski
dr hab. Agnieszka Grinn-Gofroń, prof. US
Poprzednie projekty:
dr hab. Łukasz Jankowiak, prof. US; dr Marta Cholewa [były pracownik]
dr hab. Łukasz Jankowiak
Skład zespołu:
dr hab. Wioleta Dudzińska, prof. US – kierownik
dr Katarzyna Sielatycka
dr Agnieszka Maruszewska
dr inż. Agata Wszołek
dr Danuta Cembrowska-Lech
mgr Kinga Rybak
dr inż. Ewa Skotnicka – pracownik dydaktyczny
mgr Elżbieta Dacka -pracownik techniczny
Kontakt: dr hab. Wioleta Dudzińska, tel. 91 444 1597, e-mail: wioleta.dudzinska@usz.edu.pl
Skład Katedry:
dr hab. Marianna Soroka, prof. US – kierownik katedry
dr hab. Anna Rymaszewska, prof. US
dr hab. Beata Wodecka, prof. US
dr hab. Małgorzata Adamska
mgr Barbara Wąsowicz
mgr Valentyna Kolomiiets – pracownik techniczny
Tematyka badawcza:
Skład Katedry:
prof. dr hab. inż. Robert Czerniawski – kierownik katedry
dr hab. Katarzyna Dziewulska, prof. US
dr hab. Łukasz Sługocki
dr Aleksandra Bańkowska
dr Lucyna Kirczuk
dr Tomasz Krepski
mgr inż. Anna Kompowska
mgr Iwona Goździk
Katedra prowadzi badania z zakresu: biologii, ekologii i ochrony małych rzek, strumieni i jezior; restytucji i ochrony wędrownych ryb; histologicznych struktur tkanek zwierząt wodnych; biologii i biotechnologii nasienia ryb oraz parazytologii ryb.
Kontakt: prof. dr hab. inż. Robert Czerniawski tel. 91 444 1624, e-mail: robert.czerniawski@usz.edu.pl
Interdyscyplinarny zespół łączący nauki o kulturze fizycznej, nauki medyczne oraz nauki biologiczne.
Skład zespołu:
dr Dorota Kostrzewa-Nowak (lider, Centrum Badań Strukturalno-Funkcjonalnych Człowieka US),
prof. dr hab. Andrzej Ciechanowicz (Instytut Nauk o Kulturze Fizycznej US),
dr Danuta Cembrowska-Lech (koordynator, Instytut Biologii US),
dr Robert Nowak (Instytut Nauk o Kulturze Fizycznej US),
dr Alicja Trzeciak-Ryczek
Kluczowe projekty badawcze realizowane przez zespół:
1. Badanie wybranych szlaków sygnalizacji komórkowej uruchamianych w następstwie różnych typów wysiłku fizycznego
Głównym celem projektu jest ocena wpływu 2 typów wysiłku fizycznego: tlenowego i beztlenowego, na poziom ekspresji genów kodujących czynniki transkrypcyjne indukowane niedotlenieniem HIF-1α i HIF-2α w komórkach jądrzastych krwi obwodowej oraz poziom tych białek w łożysku naczyniowym. Badania obejmują także mechanizmy regulacji poziomu ekspresji badanych genów. Planowane jest określenie roli proteasomu w regulacji poziomu badanych czynników transkrypcyjnych na poziomie białka, a także ich udział jako modulatorów indukujących procesy naprawcze i/lub aktywujących szklaki autofagii i apoptozy w komórkach jądrzastych krwi obwodowej.
2. Zastosowanie badań in silico w poszukiwaniu nowych modeli w badaniach podstawowych (biologia syntetyczna)
Głównym celem badań jest ocena pseudogenizacji wybranych genów (m.in. humaniny) w szerokim panelu taksonomicznym, optymalizacja kodonów synonimicznych w kontekście poznania roli metabolicznej wybranych białek oraz poszukiwanie narzędzi o zupełnie nowych funkcjonalnościach, pozwalających na projektowanie nowych modeli badawczych stosownych w biologii medycznej.
Stosowane metody i techniki badawcze: rutynowe analizy biochemiczne i hematologiczne; analiza poziomu białek przy pomocy testów ELISA oraz Western-blott; badanie ekspresji antygenów powierzchniowych oraz wybranych białek techniką cytometrii przepływowej; zastosowanie metod spektroskopowych, chromatograficznych (HLPC) oraz elektroforetycznych do oceny wybranych analitów w płynach ustrojowych; szeroki panel metod oceny indukcji i egzekucji śmierci komórek; wykorzystanie narzędzi biologii molekularnej do oceny ekspresji genów kodujących wybrane czynniki sygnalizacyjne oraz antygeny powierzchniowe; sekwencjonowanie nowej generacji (NGS) genomów oraz transkryptomów; inżynieria genetyczna; metody izolacji i kriokonserwacji komórek krwi obwodowej. Badania in silico obejmować będą bioinformatyczne modelowanie, symulacje oraz wizualizacje procesów biologicznych i medycznych z wykorzystaniem algorytmów i systemów eksploracji danych oraz ogólnodostępnych baz naukowych.
http://www.cbsfc.usz.edu.pl/
http://bio.usz.edu.pl/projekty-grantowe-odpowiedzialny-spolecznie-proto_lab/
https://www.youtube.com/watch?v=50Eh9-R_Ud4
Kontakt:
Dr Dorota Kostrzewa-Nowak
Centrum Badań Strukturalno-Funkcjonalnych Człowieka US
ul. Narutowicza 17c, 70-240 Szczecin
tel. +48 91 444 10 77
e-mail: dorota.kostrzewa-nowak@usz.edu.pl
Dr Danuta Cembrowska-Lech
Instytut Biologii US
ul. Wąska 13, 71-415 Szczecin
tel. +48 91 444 16 11
e-mail: danuta.cembrowska-lech@usz.edu.pl
Skład zespołu:
dr hab. Lidia Skuza, prof. US – lider
dr Magdalena Achrem
dr Anna Kalinka
dr Ewa Filip
dr Izabella Szućko-Kociuba
Zespół prowadzi badania w zakresie biologii molekularnej, cytogenetyki klasycznej i molekularnej, epigenetyki i proteomiki. Celem badań jest m.in. analiza struktury genomów jądrowego i organellowych roślin i zwierząt, analiza zmian epigenetycznych w genomach roślinnych, analiza białek gluteninowych, analiza wpływu nanopierwiastków na organizmy wodne, analizy mechanizmów naturalnej hiperakumulacji i hipertolerancji roślin na metale ciężkie.
Subdyscyplina: rolnictwo i ogrodnictwo
Kontakt: dr hab. Lidia Skuza, prof. US, tel. 91 444 1535, e-mail: lidia.skuza@usz.edu.pl
Skład zespołu:
dr Anna Orłowska – lider
dr Paulina Król
mgr Piotr Karczyński
Zespół prowadzi badania w zakresie biotechnologii zielonej dotyczącej wyjaśniania na poziomie fizjologicznym, biochemicznym i molekularnym procesów związanych z indukcją embriogenezy somatycznej, promocją wzrostu roślin przez bakterie glebowe oraz indukcją odporności roślin przeciwko patogenom grzybowym roślin. Subdyscypliny: fizjologia roślin, biochemia roślin, mikrobiologia roślin.
Kontakt: dr Anna Orłowska, tel. 91 444 1695, e-mail: anna.orlowska@usz.edu.pl
Skład zespołu:
dr Agnieszka Maruszewska – lider
dr Anna Bucior-Kwaczyńska
mgr Agata Wszołek
Zespół prowadzi badania w zakresie biologii komórek nowotworowych oraz fitoterapii. Celem grupy jest badanie potencjału antynowotworowego ekstraktów z wybranych roślin krajowych, które są wymieniane w VI- i VII-wiecznych polskich opracowaniach zielnikowych roślin leczniczych.
Kontakt: dr Agnieszka Maruszewska tel. 91 444 1554, e-mail: agnieszka.maruszewska@usz.edu.pl
Skład zespołu:
dr hab. Beata Hukowska-Szematowicz, prof. US – lider,
dr n. med. Małgorzata Blatkiewicz
Kluczowe projekty badawcze realizowane przez zespół:1. Określenie roli cząsteczek mikroRNA w przebiegu chorób o podłożu infekcyjnym oraz środowiskowym. Badania prowadzone przy wykorzystaniu króliczego modelu eksperymentalnego po zakażeniu wirusem Lagovirus europaeus.
2. Ocena procesów immunologicznych zachodzących w stanach patologicznych u ssaków (model króliczy).
3. Wykorzystanie analiz in silico w identyfikacji zjawisk zachodzących na poziomie molekularnym (zmienność genetyczna, filogeneza, filodynamika) u wirusów RNA i DNA.
Stosowane metody i techniki badawcze: PCR, RT, ddPCR, real-time PCR, cytometria przepływowa, ELISA, Western-blott, techniki immunologiczne, bioinformatyczne modelowanie procesów biologicznych, analizy statystyczne.
Kontakt: dr hab. Beata Hukowska-Szematowicz, prof. US, tel. 91 444 1592, e-mail: beata.hukowska-szematowicz@usz.edu.pl
for english see below
Skład osobowy:
Doktoranci:
Tematyka badań prowadzonych przez zespół:
1. Mechanizmy odporności przeciwwirusowej gospodarza na przykładzie zakażenia wirusem Lagovirus europaeus w modelu króliczym;
2. Detekcja oraz ocena korelacji odpowiedzi immunologicznej organizmu na rozwój chorób nowotworowych, głównie mediowanych zakażeniami wirusowymi (EBV,HSV1, HSV2, HPV);
3. Rola wybranych wskaźników immunologicznych (w tym TLR, CD200, PD-1, PD-L1) jako markerów zakażeń wirusowych, w tym m.in. SARS-CoV-2
4. Immunofenotypowanie krwi obwodowej u pacjentów z różnym przebiegiem COVID-19
5. Wpływ cytokin i czynników na ocenę potencjału pro-przerzutowego (metastatycznego) komórek nowotworowych raka jajnika, jelita, żołądka i trzustki.
6. Zjawiska immunologiczne i ekspresja cytokin prozapalnych w tkankach jamy ustnej.
7. Ocena bezpieczeństwa mikrobiologicznego karm dla zwierząt domowych.
Kluczowe projekty badawcze realizowane przez zespół:
1. Opracowanie nowoczesnych technologii laboratoryjnych, informatycznych i bioinformatycznych dedykowanych diagnostyce i prewencji zakażeń SARS CoV-2.
2. Infekcje wirusami EBV (Epstein-Barr Virus) i HPV (Human Papilloma Virus) u pacjentów z nowotworami złośliwymi głowy i szyi a przebieg biologiczny oraz kliniczny nowotworu;
3. Detekcja wybranych Herpeswirusów (HPV, EBV, HSV1, HSV2) u zróżnicowanych grup badawczych;
4. Wpływ restrykcji kalorycznej na poziom chemeryny i jej receptorów w raku jajnika (ovarian carcinoma);
5. Wpływ restrykcji kalorycznej na produkcję Sirtuin w raku żołądka (gastric adenocarcinoma) oraz udział SIRT w nowotworzeniu.
6. Badania potencjału neuro- i osteogennego komórek macierzystych zębów mlecznych.
7. Hodowle komórek dziąsła, ozębnej i MSC na powierzchni implantów medycznych wytwarzanych przyrostowo nowoczesną technologią druku FFF.
8. Ekspresja cytokin prozapalnych w chorobach przyzębia.
Współpraca:
· prof. dr hab. n. med. Ewelina Grywalska – Katedra i Zakład Immunologii Klinicznej, Uniwersytet Medyczny w Lublinie
· prof. dr hab. n. med. Miłosz Parczewski – Klinika Chorób Zakaźnych, Tropikalnych i Nabytych Niedoborów Immunologicznych, Pomorski Uniwersytet Medyczny w Szczecinie
· dr n. wet. Tomasz Piasecki – Zakład Chorób Ptaków, Zwierząt Egzotycznych, Futerkowych i Laboratoryjnych, Uniwersytet Przyrodniczy we Wrocławiu
· dr n. wet. Tuija Gadd – Fiński Urząd ds. Żywności, Helsinki, Finlandia
· dr n. med. Rafał Becht – Oddział Kliniczny Onkologii, Chemioterapii i Immunoterapii Nowotworów, Pomorski Uniwersytet Medyczny w Szczecinie
· dr n. stom. Alicja Zawiślak – Zakład Stomatologii Zintegrowanej, Pomorski Uniwersytet Medyczny w Szczecinie
· dr Massimiliano Baratelli – HIPRA, Amer, Spain
· dr Bernd Köllner – Department of Experimental Animal Facilities and Biorisk Management, Friedrich-Loeffler-Institute, Greifswald-Insel Riems, Germany
· dr Claudia Müller – Institute of Immunology, Friedrich-Loeffler-Institute, Greifswald-Insel Riems, Germany
· Jaime Maldonado – HIPRA, Amer, Spain
Stosowane metody i techniki badawcze:
1. Cytometria przepływowa,
2. PCR, real-time PCR, RT-PCR, qPCR,
3. Klasyczne metody immunologiczne,
4. SDS-PAGE,
5. Immunohistochemia;
6. Hodowle komórkowe (w tym komórek nowotworowych),
7. ELISA,
8. Western Blot.
Podstawowa aparatura badawcza:
1. Urządzenie do Real-Time PCR LightCycler 480
2. Urządzenie do Real-Time PCR LightCycler 1.5
3. Cytometr przepływowy BD FACSCanto II
Kontakt:
Dr hab. Paulina Niedźwiedzka-Rystwej, prof. US
Uniwersytet Szczeciński
Instytut Biologii
Ul. Wąska 13, 71-415 Szczecin
tel. +48 91 444 1593
e-mail: paulina.niedzwiedzka-rystwej@usz.edu.pl Strona internetowa : https://immuno.usz.edu.pl/
Members
• Paulina Niedźwiedzka-Rystwej, PhD, Assoc. Prof. – leader
• Agata Poniewierska-Baran, PhD
• Dominika Bębnowska, MSc
• Rafał Hrynkiewicz, MSc
PhD students
• Olga Sierawska, MSc
• Paulina Małkowska, MSc
• Behnam Ahmazadeh, MSc
Research topics conducted by the team:
1. Mechanisms of host antiviral immunity exemplified by infection with Lagovirus europaeus virus in a rabbit model;
2. Detection and evaluation of the correlation of the immune response to the development of cancer diseases, mainly mediated by viral infections (EBV, HSV1, HSV2, HPV);
3. The role of selected immunological biomarkers (including TLR, CD200, PD-1, PD-L1) as indicators of viral infections, including SARS-CoV-2
4. Peripheral blood immunophenotyping in patients with COVID-19
5. Influence of cytokines and factors on the assessment of the pro-metastatic (metastatic) potential of cancer cells in ovarian, intestine, stomach and pancreatic cancer.
6. Immunological phenomena and the expression of pro-inflammatory cytokines in the tissues of the oral cavity.
7. Assessment of microbiological safety of pet food.
Key research projects carried out by the team:
1. Development of modern laboratory, IT and bioinformatics technologies dedicated to the diagnosis and prevention of SARS CoV-2 infections.
2. EBV (Epstein-Barr Virus) and HPV (Human Papilloma Virus) infections in patients with head and neck cancer and the biological and clinical course of the tumor;
3. Detection of selected Herpesviruses (HPV, EBV, HSV1, HSV2) in various research groups;
4. Effect of caloric restriction on the level of chemerin and its receptors in ovarian carcinoma;
5. Effect of caloric restriction on Sirtuin production in gastric adenocarcinoma and the participation of SIRT in neoplasm.
6. Research on the neuro- and osteogenic potential of primary tooth stem cells.
7. Cultures of gingiva, periodontium and MSC cells on the surface of medical implants incrementally produced with the use of modern FFF printing technology.
8. Expression of pro-inflammatory cytokines in periodontal diseases.
Cooperation:
• prof. Ewelina Grywalska – Department of Clinical Immunology and Immunotherapy, Medical University of Lublin, Lublin, Poland
• prof. Miłosz Parczewski – Department of Infectious, Tropical Diseases and Immune Deficiency, Pomeranian Medical University in Szczecin, Szczecin, Poland
• dr Tomasz Piasecki – Department of Epizootiology and Clinic of Bird and Exotic Animals, Wrocław University of Environmental and Life Sciences, Wrocław, Poland
• dr Tuija Gadd – Finnish Food Authority, Helsinki, Finland
• dr Rafał Becht – Clinical Department of Oncology, Chemotherapy and Cancer Immunotherapy, Pomeranian Medical University of Szczecin, Szczecin, Poland
• dr Massimiliano Baratelli – HIPRA, Amer, Spain
• dr Bernd Köllner – Department of Experimental Animal Facilities and Biorisk Management, Friedrich-Loeffler-Institute, Greifswald-Insel Riems, Germany
• dr Claudia Müller – Institute of Immunology, Friedrich-Loeffler-Institute, Greifswald-Insel Riems, Germany
• Jaime Maldonado – HIPRA, Amer, Spain
Research methods and techniques:
1. Flow cytometry,
2. PCR, real-time PCR, RT-PCR, qPCR,
3. Classic immunological methods,
4. SDS-PAGE,
5. Immunohistochemistry;
6. Cell cultures (including cancer cells),
7. ELISA,
8. Western Blot.
Basic research equipment:
1. Real-Time PCR LightCycler 480
2. Real-Time PCR LightCycler 1.5
3. BD FACSCanto II
Contact:
Paulina Niedźwiedzka-Rystwej, PhD, Assoc. Prof.
University of Szczecin
Institute of Biology
Ul. Wąska 13, 71-415 Szczecin
tel. (+48) 91 444 1593 Website: https://immuno.usz.edu.pl/